磁懸浮冷水機作為制冷領域的通用裝備，安全性能至關重要，制冷系統的事故可能有：液擊、排氣壓力過高、蒸發器內載冷劑凍結、制冷壓縮機配用電動機過載等，為此，制冷系統均應針對具體情況設置一定的保護裝置。雷茨磁懸浮冷水機組具有多重保護機制：

高壓保護：高壓保護就是是檢測系統內制冷劑壓力是否正常，在壓力超出允許范圍時，壓力開關動作，并將異常信號傳給高壓控制器，處理后會停止制冷系統的工作，并將故障顯示出來。

低壓保護：低壓保護檢測的是系統中的回氣壓力，作用是防止系統壓力過低或者沒有制冷劑運行而損壞壓縮機。如果系統泄漏，沒有制冷劑，強制運行將損壞壓縮機，這時低壓保護可以及時反應，控制系統停止和顯示故障，保護壓縮機和制冷系統。

防凍保護：蒸發器如果太臟或者結霜太嚴重，此時冷氣不能和外面的熱空氣充分熱交換而引起內機結冰，室內防凍解保護就是為了壓縮機在內機結冰前使壓縮機停機，起到保護壓縮機作用。防凍結一般會設定一個值，比如3℃，這時室外風扇或降低壓縮機轉速，提高冷凝壓力和蒸發壓力，從而提高蒸發溫度。如果蒸發器溫度進一步降低至0℃以下，壓縮機也停止工作。如果室內蒸發器溫度升高至正常值時，比如6℃，壓縮機和室外風扇正常運行。室內防凍結保護就是為了壓縮機在內機結冰前，能夠使壓縮機停機，起到保護壓縮機和制冷系統的作用。

排氣溫度保護：排氣溫度過高導致制冷劑分解，絕緣材料的老化，潤滑油結碳，氣閥損壞，還會使毛細管和干燥過濾器堵塞。保護方法主要是用溫控器感應排氣溫度，溫控器應安放靠近排氣口處，排氣溫度過高時，溫控器動作，切斷電路。

機殼溫度保護：機殼溫度會影響壓縮機的壽命。機殼溫度過高可能起因于冷凝器的換熱能力不足，所以應檢查磁懸浮冷水機冷凝器的風量或水量，水溫是否合適，制冷系統內混入空氣或其它不凝性氣體，冷凝壓力就會上升，機殼過熱；吸氣溫度過高，機殼容易過熱，此外，電動機過熱也會機殼過熱。

電流保護：當線路發生短路時，重要特征之一是線路中的電流急劇增大，這就需要設置相應的當電流流過某一預定值時，反應于電流升高而動作的保護裝置叫過電流保護。

過熱保護：設計良好并在規定條件下運轉的電動機，內部溫度不會超過允許值，但電動機在過高或過低的電壓下運轉，或在高溫環境下運轉時，電動機內部溫度超過允許值，在頻繁起動時，更會因起動電流過大使溫度過高。

延時啟動保護：磁懸浮冷水機運行過程，會因為各種原因，壓縮機停止運行，這時系統中的高、低壓力不會馬上平衡，如果此時啟動壓縮機，可能會由于壓力問題導致啟動電流過大，燒毀空調，因此，目前的空調器均設有延時啟動保護，即每次壓縮機停止運行后均經過3-5分鐘的延遲，才能再次啟動。

相序保護：相序保護是能自動相序識別的保護繼電器，避免一些制冷壓縮機等因為電源相序接反后（三根火線順序接反）倒至電機反轉從而導致事故或設備損壞。比如：渦旋壓縮機和活塞式壓縮機的結構不同。由于三相電源的逆變會引起壓縮機的逆變，所以不能逆變。因此，需要安裝反相保護器來防止冷水機組的反轉。當安裝反相保護器時，壓縮機可以在正相時工作。當發生相反的相位時，有必要將電源的兩條線改變為正相。

相間不平衡保護：磁懸浮冷水機相間不平衡電壓將會導致三相不平衡電流，從而導致更大的溫升—設置過載繼電器。在電流的最大相中，溫升增加的比例約為電壓不平衡比例平方的兩倍。如3%的電壓不平衡會產生約18%的溫升。